Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5460Q3UQ97 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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