Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms