Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q3UPC7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q3UPC7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q3UPC7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q3UPC7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3UPC7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3UPC7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3UPC7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3UPC7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms