Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrc4Q3UP24 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms