Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E330014E10RikQ3UL33 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E330014E10RikQ3UL33 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E330014E10RikQ3UL33 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E330014E10RikQ3UL33 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E330014E10RikQ3UL33 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E330014E10RikQ3UL33 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E330014E10RikQ3UL33 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E330014E10RikQ3UL33 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E330014E10RikQ3UL33 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
E330014E10RikQ3UL33 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E330014E10RikQ3UL33 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E330014E10RikQ3UL33 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
E330014E10RikQ3UL33 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E330014E10RikQ3UL33 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E330014E10RikQ3UL33 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E330014E10RikQ3UL33 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
E330014E10RikQ3UL33 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E330014E10RikQ3UL33 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E330014E10RikQ3UL33 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E330014E10RikQ3UL33 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E330014E10RikQ3UL33 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E330014E10RikQ3UL33 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E330014E10RikQ3UL33 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E330014E10RikQ3UL33 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E330014E10RikQ3UL33 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E330014E10RikQ3UL33 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E330014E10RikQ3UL33 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E330014E10RikQ3UL33 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E330014E10RikQ3UL33 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E330014E10RikQ3UL33 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E330014E10RikQ3UL33 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E330014E10RikQ3UL33 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E330014E10RikQ3UL33 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E330014E10RikQ3UL33 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
E330014E10RikQ3UL33 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E330014E10RikQ3UL33 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
E330014E10RikQ3UL33 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E330014E10RikQ3UL33 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E330014E10RikQ3UL33 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E330014E10RikQ3UL33 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E330014E10RikQ3UL33 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E330014E10RikQ3UL33 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E330014E10RikQ3UL33 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E330014E10RikQ3UL33 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms