Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Nkx6-3Q3UHX8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Nkx6-3Q3UHX8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Nkx6-3Q3UHX8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Nkx6-3Q3UHX8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Nkx6-3Q3UHX8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Nkx6-3Q3UHX8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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