Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Fam117bQ3U3E2 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Fam117bQ3U3E2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Fam117bQ3U3E2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Fam117bQ3U3E2 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Fam117bQ3U3E2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Speer4c-201ENSMUST00000095005 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Speer4d-201ENSMUST00000095006 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam117bQ3U3E2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Fam117bQ3U3E2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms