Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Otud5Q3U2S4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud5Q3U2S4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms