Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms