Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pag1Q3U1F9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms