Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hace1Q3U0D9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms