Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms