Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccndbp1Q3TVC7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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