Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3TTJ4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms