Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS39

1700066B19Rik, RIKEN cDNA 1700066B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700066B19RikQ3TS39 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.08■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.08■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.07■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.07■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.07■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.07■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.06■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.06■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.06■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700066B19RikQ3TS39 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.05■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.05■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.05■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms