Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms