Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR3

Nlrp4c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4cQ3TKR3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp4cQ3TKR3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp4cQ3TKR3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp4cQ3TKR3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp4cQ3TKR3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp4cQ3TKR3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp4cQ3TKR3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp4cQ3TKR3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp4cQ3TKR3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp4cQ3TKR3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4cQ3TKR3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4cQ3TKR3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4cQ3TKR3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4cQ3TKR3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4cQ3TKR3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4cQ3TKR3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4cQ3TKR3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4cQ3TKR3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4cQ3TKR3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4cQ3TKR3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4cQ3TKR3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4cQ3TKR3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4cQ3TKR3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4cQ3TKR3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4cQ3TKR3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4cQ3TKR3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4cQ3TKR3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4cQ3TKR3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4cQ3TKR3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4cQ3TKR3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4cQ3TKR3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4cQ3TKR3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp4cQ3TKR3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrp4cQ3TKR3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrp4cQ3TKR3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrp4cQ3TKR3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrp4cQ3TKR3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrp4cQ3TKR3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrp4cQ3TKR3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrp4cQ3TKR3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrp4cQ3TKR3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrp4cQ3TKR3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrp4cQ3TKR3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms