Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam107bQ3TGF2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam107bQ3TGF2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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