Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem248Q3TBN1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms