Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Trpm1Q2TV84 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpm1Q2TV84 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpm1Q2TV84 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpm1Q2TV84 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpm1Q2TV84 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpm1Q2TV84 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpm1Q2TV84 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpm1Q2TV84 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpm1Q2TV84 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpm1Q2TV84 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpm1Q2TV84 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpm1Q2TV84 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpm1Q2TV84 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpm1Q2TV84 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpm1Q2TV84 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpm1Q2TV84 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpm1Q2TV84 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpm1Q2TV84 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpm1Q2TV84 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms