Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Shroom4Q1W617 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
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