Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptcd3Q14C51 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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