Protein–RNA interactions for Protein: Q148W8

Dusp27, Inactive dual specificity phosphatase 27, mousemouse

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Length 1,138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp27Q148W8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
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Dusp27Q148W8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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Dusp27Q148W8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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Dusp27Q148W8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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Dusp27Q148W8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dusp27Q148W8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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Dusp27Q148W8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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Dusp27Q148W8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
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Dusp27Q148W8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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Dusp27Q148W8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dusp27Q148W8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dusp27Q148W8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dusp27Q148W8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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Dusp27Q148W8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dusp27Q148W8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dusp27Q148W8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dusp27Q148W8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dusp27Q148W8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dusp27Q148W8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dusp27Q148W8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dusp27Q148W8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Dusp27Q148W8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dusp27Q148W8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Dusp27Q148W8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dusp27Q148W8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dusp27Q148W8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dusp27Q148W8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dusp27Q148W8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dusp27Q148W8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Dusp27Q148W8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Dusp27Q148W8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Dusp27Q148W8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Dusp27Q148W8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms