Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGM9

Rtel1, Regulator of telomere elongation helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtel1Q0VGM9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms