Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim24Q0VG18 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim24Q0VG18 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim24Q0VG18 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim24Q0VG18 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim24Q0VG18 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smim24Q0VG18 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smim24Q0VG18 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim24Q0VG18 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim24Q0VG18 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim24Q0VG18 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim24Q0VG18 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim24Q0VG18 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smim24Q0VG18 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim24Q0VG18 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim24Q0VG18 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim24Q0VG18 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim24Q0VG18 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim24Q0VG18 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim24Q0VG18 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim24Q0VG18 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smim24Q0VG18 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Smim24Q0VG18 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim24Q0VG18 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim24Q0VG18 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim24Q0VG18 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smim24Q0VG18 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim24Q0VG18 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim24Q0VG18 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim24Q0VG18 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim24Q0VG18 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smim24Q0VG18 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim24Q0VG18 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim24Q0VG18 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim24Q0VG18 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smim24Q0VG18 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim24Q0VG18 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim24Q0VG18 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smim24Q0VG18 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim24Q0VG18 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim24Q0VG18 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim24Q0VG18 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms