Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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Ttc39dQ0VF76 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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Ttc39dQ0VF76 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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Ttc39dQ0VF76 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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Ttc39dQ0VF76 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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Ttc39dQ0VF76 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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Ttc39dQ0VF76 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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Ttc39dQ0VF76 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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Ttc39dQ0VF76 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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Ttc39dQ0VF76 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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Ttc39dQ0VF76 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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Ttc39dQ0VF76 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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Ttc39dQ0VF76 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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Ttc39dQ0VF76 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms