Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rundc1Q0VDN7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms