Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spata18Q0P557 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spata18Q0P557 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms