Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Neurl1bQ0MW30 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms