Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrioQ0KL02 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms