Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf541Q0GGX2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf541Q0GGX2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf541Q0GGX2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf541Q0GGX2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf541Q0GGX2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf541Q0GGX2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf541Q0GGX2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf541Q0GGX2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf541Q0GGX2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf541Q0GGX2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf541Q0GGX2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf541Q0GGX2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf541Q0GGX2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf541Q0GGX2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf541Q0GGX2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf541Q0GGX2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf541Q0GGX2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf541Q0GGX2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf541Q0GGX2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf541Q0GGX2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf541Q0GGX2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf541Q0GGX2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf541Q0GGX2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf541Q0GGX2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf541Q0GGX2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf541Q0GGX2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf541Q0GGX2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf541Q0GGX2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf541Q0GGX2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf541Q0GGX2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf541Q0GGX2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf541Q0GGX2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf541Q0GGX2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms