Protein–RNA interactions for Protein: Q09XV5

Chd8, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd8Q09XV5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd8Q09XV5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms