Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
1700061G19RikQ08EE8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700061G19RikQ08EE8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms