Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q08AU9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q08AU9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q08AU9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q08AU9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q08AU9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q08AU9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q08AU9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q08AU9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q08AU9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q08AU9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Q08AU9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q08AU9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q08AU9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q08AU9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q08AU9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q08AU9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q08AU9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q08AU9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q08AU9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Q08AU9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q08AU9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q08AU9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q08AU9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q08AU9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q08AU9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q08AU9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q08AU9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q08AU9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q08AU9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q08AU9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q08AU9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q08AU9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q08AU9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q08AU9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q08AU9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q08AU9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q08AU9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q08AU9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q08AU9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q08AU9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q08AU9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q08AU9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q08AU9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q08AU9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q08AU9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q08AU9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q08AU9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q08AU9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q08AU9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q08AU9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q08AU9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q08AU9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q08AU9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q08AU9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q08AU9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q08AU9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q08AU9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q08AU9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q08AU9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q08AU9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q08AU9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q08AU9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q08AU9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q08AU9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q08AU9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q08AU9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q08AU9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q08AU9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q08AU9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q08AU9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q08AU9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q08AU9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q08AU9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q08AU9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q08AU9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q08AU9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q08AU9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q08AU9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q08AU9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q08AU9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q08AU9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q08AU9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q08AU9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q08AU9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q08AU9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q08AU9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q08AU9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q08AU9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q08AU9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q08AU9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q08AU9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q08AU9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q08AU9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q08AU9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q08AU9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q08AU9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q08AU9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q08AU9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q08AU9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms