Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MitfQ08874 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MitfQ08874 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MitfQ08874 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MitfQ08874 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MitfQ08874 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MitfQ08874 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MitfQ08874 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MitfQ08874 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MitfQ08874 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MitfQ08874 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MitfQ08874 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MitfQ08874 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MitfQ08874 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MitfQ08874 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MitfQ08874 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MitfQ08874 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MitfQ08874 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MitfQ08874 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MitfQ08874 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MitfQ08874 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MitfQ08874 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MitfQ08874 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MitfQ08874 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MitfQ08874 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MitfQ08874 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MitfQ08874 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MitfQ08874 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MitfQ08874 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MitfQ08874 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MitfQ08874 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MitfQ08874 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MitfQ08874 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MitfQ08874 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MitfQ08874 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MitfQ08874 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MitfQ08874 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MitfQ08874 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MitfQ08874 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MitfQ08874 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MitfQ08874 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MitfQ08874 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MitfQ08874 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MitfQ08874 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MitfQ08874 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MitfQ08874 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MitfQ08874 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MitfQ08874 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MitfQ08874 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MitfQ08874 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MitfQ08874 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MitfQ08874 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MitfQ08874 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MitfQ08874 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MitfQ08874 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MitfQ08874 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MitfQ08874 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MitfQ08874 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MitfQ08874 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MitfQ08874 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms