Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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