Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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