Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms