Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms