Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms