Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top1Q04750 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top1Q04750 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top1Q04750 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top1Q04750 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top1Q04750 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top1Q04750 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top1Q04750 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top1Q04750 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top1Q04750 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top1Q04750 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top1Q04750 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Top1Q04750 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top1Q04750 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top1Q04750 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms