Protein–RNA interactions for Protein: Q04742

Emx1, Homeobox protein EMX1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx1Q04742 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emx1Q04742 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms