Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms