Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Crisp3Q03402 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Crisp3Q03402 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Crisp3Q03402 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Crisp3Q03402 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Crisp3Q03402 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Crisp3Q03402 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Crisp3Q03402 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Crisp3Q03402 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Crisp3Q03402 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Crisp3Q03402 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Crisp3Q03402 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Crisp3Q03402 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Crisp3Q03402 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Crisp3Q03402 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Crisp3Q03402 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Crisp3Q03402 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Crisp3Q03402 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Crisp3Q03402 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Crisp3Q03402 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Crisp3Q03402 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Crisp3Q03402 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Crisp3Q03402 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Crisp3Q03402 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Crisp3Q03402 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Crisp3Q03402 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Crisp3Q03402 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Crisp3Q03402 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Crisp3Q03402 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Crisp3Q03402 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Crisp3Q03402 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms