Protein–RNA interactions for Protein: Q03401

Crisp1, Cysteine-rich secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp1Q03401 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Crisp1Q03401 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crisp1Q03401 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms