Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms