Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms