Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms