Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GscQ02591 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GscQ02591 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GscQ02591 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GscQ02591 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GscQ02591 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GscQ02591 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GscQ02591 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GscQ02591 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GscQ02591 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GscQ02591 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GscQ02591 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GscQ02591 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GscQ02591 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GscQ02591 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GscQ02591 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GscQ02591 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GscQ02591 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GscQ02591 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GscQ02591 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GscQ02591 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GscQ02591 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GscQ02591 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GscQ02591 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GscQ02591 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GscQ02591 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GscQ02591 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GscQ02591 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GscQ02591 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GscQ02591 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GscQ02591 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GscQ02591 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GscQ02591 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GscQ02591 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GscQ02591 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GscQ02591 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GscQ02591 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GscQ02591 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GscQ02591 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GscQ02591 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GscQ02591 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GscQ02591 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GscQ02591 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GscQ02591 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GscQ02591 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GscQ02591 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GscQ02591 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GscQ02591 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GscQ02591 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GscQ02591 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GscQ02591 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GscQ02591 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GscQ02591 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GscQ02591 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GscQ02591 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GscQ02591 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GscQ02591 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GscQ02591 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GscQ02591 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GscQ02591 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GscQ02591 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GscQ02591 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GscQ02591 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GscQ02591 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GscQ02591 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GscQ02591 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GscQ02591 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GscQ02591 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GscQ02591 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GscQ02591 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GscQ02591 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GscQ02591 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GscQ02591 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GscQ02591 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GscQ02591 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GscQ02591 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GscQ02591 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GscQ02591 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GscQ02591 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GscQ02591 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GscQ02591 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GscQ02591 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GscQ02591 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GscQ02591 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GscQ02591 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GscQ02591 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GscQ02591 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GscQ02591 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GscQ02591 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GscQ02591 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GscQ02591 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GscQ02591 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GscQ02591 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GscQ02591 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GscQ02591 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GscQ02591 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GscQ02591 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GscQ02591 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GscQ02591 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GscQ02591 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms