Protein–RNA interactions for Protein: Q02257

Jup, Junction plakoglobin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JupQ02257 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JupQ02257 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JupQ02257 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JupQ02257 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JupQ02257 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JupQ02257 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JupQ02257 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JupQ02257 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JupQ02257 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JupQ02257 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JupQ02257 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JupQ02257 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JupQ02257 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JupQ02257 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
JupQ02257 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JupQ02257 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JupQ02257 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JupQ02257 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
JupQ02257 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JupQ02257 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JupQ02257 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JupQ02257 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JupQ02257 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JupQ02257 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JupQ02257 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JupQ02257 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JupQ02257 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JupQ02257 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JupQ02257 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JupQ02257 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JupQ02257 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
JupQ02257 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
JupQ02257 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JupQ02257 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JupQ02257 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JupQ02257 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JupQ02257 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JupQ02257 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
JupQ02257 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JupQ02257 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JupQ02257 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
JupQ02257 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JupQ02257 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JupQ02257 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JupQ02257 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
JupQ02257 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JupQ02257 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
JupQ02257 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
JupQ02257 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JupQ02257 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JupQ02257 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
JupQ02257 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JupQ02257 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JupQ02257 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JupQ02257 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
JupQ02257 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
JupQ02257 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
JupQ02257 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
JupQ02257 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
JupQ02257 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
JupQ02257 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
JupQ02257 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
JupQ02257 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
JupQ02257 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
JupQ02257 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JupQ02257 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JupQ02257 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
JupQ02257 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
JupQ02257 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
JupQ02257 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JupQ02257 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
JupQ02257 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
JupQ02257 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JupQ02257 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
JupQ02257 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JupQ02257 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JupQ02257 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JupQ02257 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JupQ02257 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JupQ02257 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JupQ02257 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
JupQ02257 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JupQ02257 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
JupQ02257 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
JupQ02257 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JupQ02257 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JupQ02257 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JupQ02257 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JupQ02257 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JupQ02257 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JupQ02257 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JupQ02257 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JupQ02257 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JupQ02257 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
JupQ02257 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JupQ02257 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JupQ02257 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JupQ02257 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
JupQ02257 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JupQ02257 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms